Créé en 1868 sur l’initiative de Victor Duruy, l’Ecole Pratique des Hautes Etudes a pour mission de former par la pratique à la recherche fondamentale et appliquée.
Composée des sections des Sciences de la vie et de la terre, des Sciences historiques et philologiques et des Sciences religieuses, l'EPHE accueille aujourd'hui des étudiants français ou étrangers pour les préparer au doctorat, ainsi qu'à un diplôme propre à l'Etablissement et à des diplômes post doctoraux de grande spécialisation.
L'établissement s'inscrit dans le système LMD et prépare aux Masters Sciences de la vie et de la terre et Sciences historiques, ainsi qu'en sciences philologiques et religieuses. Une formation professionnelle est assurée notamment en sciences de la vie et de la terre ainsi qu'en en sciences religieuses.
Conçu comme un lieu privilégié d'initiation et de formation à la pratique de la recherche de haut niveau, l'EPHE s'appuie sur un certain nombre d'Unités mixtes de recherche (UMR) liées au CNRS, à des universités, ou à de grands organismes spécialisés, comme l'INSERM ou l'INRA.